慢性淋巴細胞白血病（CLL）向高級別B細胞淋巴瘤的性淋血病轉化被稱為Richter綜合征（RS），較為罕見，巴細胞白而且這類患者的轉組和轉錄組學預后較差。

在該研究中，基因研究人員對17位參與臨床試驗（CHOP-O）的特征患者的配對的血液循環中的CLL（PB-CLL）和RS活檢組織（組織-RS）進行了全基因組測序（WGS）。

研究流程

結果顯示，性淋血病在組織-RS中，巴細胞白低風險CLL驅動和DNA損傷反應（DDR）通路上的轉組和轉錄組學基因突變有富集現象。此外，基因研究人員還篩選到了既往未在RS中報道過的特征遺傳變異，包括蛋白酪氨酸磷酸化酶受體（PTPRD）和腫瘤壞死因子受體相關因子三（TRAF3）。性淋血病

Richter綜合征患者的巴細胞白SNV、InDel、轉組和轉錄組學CNA

在非編碼基因組中，基因研究人員在組織-RS中發現了與AID相關和無關的特征kataegis，會影響關鍵免疫調節基因的調控區域。這些包括BTG2、CXCR4、NFATC1、PAX5、NOTCH-1、SLC44A5、FCRL3、SELL、TNIP2和TRIM13。

RS過程中體細胞突變的癌細胞比例值的變化

此外，PB-CLL對和組織-RS樣本對的整體突變特征之間的差異表明，DDR是驅動CLL惡性轉化的主要機制。基于信號通路的克隆反卷積分析顯示，MAPK和DDR通路中的基因存在高克隆擴增可能性。通過RNA表達譜對來自獨立隊列的淋巴結-CLL和組織-RS對進行直接比較證實了相同信號通路的差異表達。

總而言之，該研究通過對WGS和RNA表達數據進行綜合分析大大擴展了既往的靶向方法，打破了缺乏胚系樣本的限制，有助于鑒定與RS轉化有關的新型基因組關聯，可提高新的治療靶點。

原始出處：

Klintman Jenny,Appleby Niamh,Stamatopoulos Basile et al. Genomic and transcriptomic correlates of Richter's transformation in Chronic Lymphocytic Leukemia.[J] .Blood, 2020, 10.1182/blood.2020005650