TET家族5-甲基胞嘧啶羥化酶包括了TET1、生物生物示TET2和TET3,醫學研究院分催化DNA 5位甲基胞嘧啶(5mC)的細胞學團三步氧化反應,最終實現胞嘧啶的隊揭去甲基化過程,在基因組表觀遺傳調控中扮演重要角色。生物生物示與多數表觀遺傳修飾酶類似,醫學研究院分TET2蛋白本身并不具備識別特定DNA序列的細胞學團結構域,那么TET2是隊揭如何被招募道染色質上并發揮生物學功能呢?
從轉錄因子WT1和去甲基化酶TET2在急性髓系白血病(AML)中存在突變互斥的遺傳學現象入手,復旦大學生物醫學研究院分子細胞生物學團隊(簡稱“MCB團隊”)發現WT1招募TET2到基因組特定區域,生物生物示行使其去甲基化酶功能,醫學研究院分決定WT1下游靶基因轉錄(Wang et al. Mol Cell. 2015)。細胞學團該論文被選為Mol Cell編輯推薦文章,隊揭配發同期述評,生物生物示也被Cancer discovery編輯選為亮點文章。醫學研究院分受這項工作的細胞學團啟發,MCB團隊構建了包含1400多個轉錄因子文庫,篩選并發現了除WT1之外的一批與TET2蛋白相互作用的轉錄調節因子,包括轉錄因子、轉錄共激活子、蛋白結構域等。進一步研究發現,TET2通過轉錄共激活子SNIP1與轉錄因子c-MYC結合,三者形成三元復合物,調控c-MYC下游靶基因轉錄,影響DNA 損傷應激和細胞凋亡,為解析TET2參與維持基因組穩定性提供了新機制(Chen et al. Cell Reports. 2018)。
近日,MCB團隊研究發現,ZSCAN蛋白能夠通過其SCAN結構域與TET2蛋白相結合,為理解TET2是如何被招募道染色質上并發揮生物學功能提供了新的認識。7月14日,相關成果以《Zscan4-Tet2轉錄軸調控代謝及蛋白質穩態促進誘導性多能干細胞重編程》(“The Zscan4-Tet2 Transcription Nexus Regulates Metabolic Rewiring and Enhances Proteostasis to Promote Reprogramming”)為題在線發表于《細胞》(Cell)子刊《細胞報告》(Cell Reports)雜志。
SCAN結構域是一個高度保守的區域,主要發現在C2H2鋅指結構域的N端,并特異地存在于脊椎動物中。但是,大部分ZSCAN家族成員的生物學功能尚不明了。在人的SCAN家族蛋白中一共包含有57個成員,而在小鼠的SCAN家族蛋白中包含有43個成員。以ZSCAN家族成員之一Zscan4f為例,復旦MCB團隊研究發現Tet2蛋白能被Zscan4f招募到其靶基因的啟動子區域,去除DNA甲基化并激活基因表達,刺激糖酵解途徑和提高蛋白酶體活性,最終促進誘導性多能干細胞的重編程,豐富了人們對TET2調控靶基因轉錄和發揮生物學功能的科學認知。鑒于眾多ZSCAN蛋白能夠與TET2蛋白相結合,該工作也為ZSCAN蛋白功能研究提供了全新研究思路。
復旦大學博士程舟禮為論文第一作者,復旦大學生物醫學研究院教授葉丹、上海交通大學醫學院教授張明亮為共同通訊作者。該工作還得到了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院教授劉興國、中科院生化細胞所研究員李勁松、中國科學院上海巴斯德研究所教授江陸斌、浙江大學教授劉鵬淵和教授郭行等的大力支持。
Tet2-Zscan4f復合物參與調控靶基因轉錄和促進體細胞重編程
論文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124720308585?via%3Dihub
MCB團隊相關成果:
Wang, Yiping, et al. WT1 recruits TET2 to regulate its target gene expression and suppress leukemia cell proliferation. Molecular Cell 57.4 (2015): 662-673.
Chen, Lei-Lei, et al. SNIP1 recruits TET2 to regulate c-MYC target genes and cellular DNA damage response. Cell Reports 25.6 (2018): 1485-1500.
制圖:實習編輯:責任編輯:李沁園