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優勢片段雜交策略在藥物研發中的應用

優勢片段的優勢藥物研發應用雜交策略

優勢片段雜交策略在藥物研發中的應用

是一種經典的藥物設計方法,它是片段依據現有的結構特征,將具有不同生物活性的雜交中藥效團片段通過“強強聯合”組合得到的新化學實體的過程。優勢片段的策略雜交策略可提高化合物的生物活性和藥代性質,相比于傳統的優勢藥物研發應用藥物研發,這種基于結構方法的片段成功率更高,具有較為廣闊的雜交中應用前景。

01

LSD1抑制劑的策略研發

反式-2-苯基環丙胺(PCPA)對單胺氧化酶(MAOs)具有較強的抑制活性,可用于治療抑郁癥。優勢藥物研發應用另外,片段MAOs與賴氨酸特異性脫甲基化酶(LSD)的雜交中結構具有高度同源性,所以PCPA對LSD也有較強的策略抑制活性,主要是優勢藥物研發應用與LSD的催化位點進行共價結合。研究者通過分析PCPA與LSD復合物和FAD與N-炔烴丙基賴氨酸肽段的片段晶體結構,設計合成了一系列LSD抑制劑,雜交中其中衍生物1和2對H3K4甲基化的抑制活性最強,且衍生物2具有顯著的抗腫瘤細胞增殖活性。隨后,該研究者通過借鑒西班牙Oryzon Genomics公司的明顯分子3,通過優勢片段雜交策略,得到的衍生物4對LSD的抑制活性和選擇性均顯著提高,且對SH-SY5Y神經母細胞和HeLa宮頸癌細胞的增殖也有較強的抑制活性。

02

Mcl-1抑制劑的研發

髓細胞白血病因子-1在多種腫瘤細胞中均有高表達,對腫瘤細胞的異常增殖具有促進作用。有研究通過核磁共振技術發現,有2類結構可與Mcl-1的不同位點結合,故通過優勢片段的雜交策略得到了具有新骨架結構的活性分子5,親和力提高了近100倍,解離常數小于100nmol/L,為一類高選擇性的Mcl-1抑制劑。

03

NMT抑制劑的研發

通過高通量篩選得到的衍生物6和7對N-肉豆蔻酰基轉移酶(NMT)具有較強的抑制活性,研究人員在此基礎上,根據衍生物的晶體結構,利用分子雜交策略得到的衍生物8,對NMT的抑制活性提高了40倍,且選擇性也得到了相應的提高。

04

抗HIV-1藥物的研發

研究者對比分析衍生物9和10與HIV-1非核苷類逆轉錄酶的對接結果發現,氨基甲酸酯基是產生高效抗耐藥性的關鍵因素之一,另外衍生物9與HIV-1非核苷類逆轉錄酶的X-射線晶體復合物顯示,3,5-二氯苯基與氨基酸殘基可通過氫鍵相互作用。故研究者將3,5-二氯苯基“嫁接”到衍生物10的稠雜環結構骨架中,同時避免引入手性中心,降低合成的難度,得到吲唑類新型抗HIV藥物11。

隨后另有研究人員通過分子對接及優勢片段雜交策略,發現了新型的吡啶酰胺及吡啶酮類衍生物對HIV有較強的抑制活性。

基于優勢片段雜交策略在藥物設計中具有思路清晰、研發時間短及成本低等優勢,但是在實際操作時需要借助一部分外界的力量,如藥物與靶點的晶體結構及分子對接技術等,另外在進行分子雜交過程中可能會導致目標化合物的分子量過大、理化性質發生改變等缺點。

參考文獻

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來源:新浪醫藥。

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